选用抗病品种；一般种子要用0.1％高锰酸钾液或10％磷酸三钠液浸种15到20分钟，捞出后用清水冲洗干净，催芽播种；无病土育苗，育出无病壮苗。疫病危害，可以用烯酰吗啉，乙铝.锰锌，氟吗啉，腈霜唑，霜霉威盐酸盐，抑快浄，氟啶胺，霜脲氰等加磷酸二氢钾叶面肥防治。实行轮作、深翻改土，结合深翻，土壤喷施“免深耕”调理剂，增施有机肥料、磷钾肥和微肥，适量施用氮肥，改善土壤结构，提高保肥保水性能，促进根系发达，植株健壮。种子严格消毒，培育无菌壮苗；定植前7天和当天，分别细致喷洒两次植物生长调节剂和保护剂，做到净苗入室，减少病害发生。栽植前实行火烧土壤、高温焖室，铲除室内残留病菌，栽植以后，严格实行封闭型管理，防止外来病菌侵入和互相传播病害。
辣椒疫病防治方法：加强田间管理，通风透光降湿，晴天浇水，防治高温高湿。及时清除病株、病果，雨季及时排涝。农药防治：发病初期喷施25%瑞毒霉可湿性粉剂750倍液，或40%的乙磷铝可湿性粉剂200倍液，或75%的百菌清可湿性粉剂800倍液，或64%的杀毒矾可湿性粉剂500倍液，每隔7-10天喷1次，连续2-3次，病害严重时隔5-7天喷1次，连续2-3次。
