红薯常见病害主要有红薯黑斑病、红薯茎线虫病及红薯根腐病。病害防治应遵循“预防为主，综合防治”的方针，坚持“农业防治、物理防治、生物防治为主，化学防治为辅”的无公害化治理原则。利用自然界害虫的天敌防治虫害是一种有效方法，需注意保护害虫的自然天敌，创造有利于天敌生存的条件，或通过人工饲养繁殖和释放天敌，增加其数量以抑制虫害。利用害虫的致病微生物（如真菌、细菌、病毒）防治害虫，是一种安全且效果显著的手段，有利于维持生态平衡。
红薯病害包括疮痂病、黑斑病、软腐病、枯萎病、瘟病、根腐病、紫纹羽病、病毒病、丛枝病、茎线虫病和黑痣病；虫害包括茎螟、麦蛾、天蛾、斜纹夜蛾、蚁象甲、蜡龟甲、肖叶甲、白粉虱、绮夜蛾、小地老虎、蛴螬。近年来，甘薯植株发病率常达50%以上，导致产量损失和品质下降。叶片染病后变形卷曲，芽和薯块染病后芽卷缩，薯块表面产生暗褐色至灰褐色小点或斑块，干燥时疮痂易脱落，残留疹状斑或疤痕，影响根系生长，导致根变形，发病早的受害更重。
