生物菌肥是特定肥料效应的制品，能够提高土壤肥力、改善土壤理化性状、提升作物品质和产量，因此在农业生产中应用广泛。施用微生物肥料后，果园土壤容重变小，孔隙度增大，微生物数量增加，透气性改善，有机质含量明显提高，供氮和供磷能力增强，酸碱度得到改善，有利于养分释放。
微生物肥料是将土壤中的有益微生物分离、选育、扩大培养制成的生物活性制剂，具有调节植物生长、增加产量、改善品质、改良土壤、保护生态环境等优点。其作用包括：促进作物营养吸收，芽孢杆菌等有益微生物代谢产生植物内源酶，提高氮、磷、钾等元素的吸收率；调节生命活动，增产增收；提高果实品质，侧孢芽孢杆菌等降低植物体内硝酸盐含量20%以上；分解有机物质和毒素，防止重茬；形成根际环境保护屏障，地衣芽孢杆菌等有益微生物施入土壤；增强抗逆性。
选择微生物肥料时，应注重品质、活性、均衡供应氮磷钾及微量元素、丰富的有机质，以及增加耕层土壤“有益微生物菌群”，强化土壤微生物区系，持久发挥作用。
