适期早播，加强苗间管理，促进小麦生长发育，尽量使分蘖、拔节期与麦杆蝇产卵盛期错开，以减轻危害程度，降低生产损失，提高收益率。选用抗虫品种是防治麦秆蝇最经济有效的途径，各地应加强对当地品种的鉴定，引进、培育适应当地的抗虫良种。春麦适当早播，冬麦适当晚播以避开成虫产卵为害，加强栽培管理，因地制宜、深翻土地、增施肥料、适时早播、适当浅播、合理密植、及时灌排、精耕细作，都对麦秆蝇繁殖为害不利。精细收获，铲除杂草，可减少其越夏场所。掌握越冬代成虫发生情况是药剂防治的关键，可用下列药剂：1.8%阿维菌素乳油2500倍液；10%吡虫啉可湿性粉剂2500倍液；40%乙酞甲胺磷乳油2000倍液；80%敌敌畏乳油1000倍液；25%速灭威可湿性粉剂600倍液；50%敌敌畏乳油与40%乐果乳油1：1混合后1000倍液喷雾，隔6-7天后喷第2次药，每亩喷对好的药液50-75kg，把卵控制在孵化之前。