玉米矮花叶病毒病可采用农业防治和化学防治相结合的方法。农业防治包括选用抗病品种、清除田间杂草、拔除感病弱苗、选用壮苗移栽以减少毒源,并加强肥水管理以提高抗病能力。在小麦收获时,玉米苗期在3-5叶期最易遭受灰飞虱传毒,可通过调整播期提前或推迟,错开小麦收获阶段。化学防治方面,在玉米苗期3-5叶期使用吡蚜酮或烯啶虫胺加宁南霉素喷药保护,或在麦蚜迁移盛期使用乐果乳剂1000倍液、氧化乐果1200-1500倍液喷雾一至二次,可有效杀死蚜虫介体,减轻危害。若与麦田防治蚜虫结合,效果更佳。及时防治蚜虫也能有效预防该病的发生。