香菜灰霉病由菌核遗留在土中或混杂在种子中越冬或越夏。混在种子中的菌核随播种进入田间，或土中菌核在适宜条件下萌发产生子囊盘，释放子囊孢子，通过风吹到衰弱植株伤口上引起初侵染。病部菌丝扩展至邻近植株或通过病健株直接接触进行再侵染，直至条件恶化形成菌核落入土中或混入种子间越冬或越夏。本病借气流、灌溉及农事操作从伤口、衰老器官侵入。连阴雨、寒流大风、放风不及时、密度过大、幼苗徒长、分苗移栽时伤根伤叶都会加重病情。
香菜灰霉病主要通过气流、昆虫和农事操作传播。病原以闭囊壳在病株残体上越冬，次年春温湿度适宜时释放子囊孢子，从表皮直接侵入引起初侵染。发病植株产生的分生孢子通过风雨传播进行重复侵染。病苗色浅，叶片、叶柄呈灰白色，水渍状，组织软化至腐烂，高湿时表面生有灰霉。幼茎多在叶柄基部初生不规则水浸斑，很快变软腐烂，缢缩或折倒，最后病苗腐烂枯死。
香菜灰霉病主要在夏秋季危害，空气相对湿度大、温度较高（20～24℃）时最利于发生和流行。浇水过多、施用氮肥过量、植株徒长、环境荫蔽、田间通风不良时发病较重。