大豆霜霉病为害幼苗、叶片和籽粒。当第一片真叶展开后，沿叶脉两侧出现褪绿斑块。成株叶片表面呈圆形或不规则形、边缘不清晰的黄绿色星点，后变褐色，叶背生灰白色霉层。病斑表面粘附灰白色的菌丝层，内含大量的病菌卵孢子。每年6月中下旬开始发病，7~8月是发病盛期，多雨年份常发病严重。
大豆幼苗发病，从第一对真叶基部现褪绿斑块，沿主脉、侧脉扩展，呈现淡黄色的大斑块。当湿度大时，病斑背面生灰白色霉状物。病叶转黄变褐而干枯，造成植株萎缩矮化，叶片凋萎早落，重者早期死亡。
大豆成株期叶片发病，密生圆形或不正规形的黄绿色小斑点，后渐变成褐色，周围呈深褐色，大小为2～3毫米，因受叶脉限制而呈多角形，病健交界明显。叶背的病斑上，产生灰白色霉状物，后变为灰色或淡紫色。病斑可愈合成较大的斑点，引起叶片早期大量脱落。
大豆豆荚受害，外部症状不明显，但剥开豆荚，病粒表面粘附有大量灰白色的菌丝层。主要为害幼苗或成株叶片、荚及豆粒。带病种子长出的幼苗能系统发病，子叶未见症状，从第1对真叶基部现褪绿斑块，沿主脉、侧脉扩展，造成全叶褪绿。以后全株的叶片均可显症，花期前后雨多或湿度大，病斑背面生有灰色霉层，病叶转黄变褐而干枯。
为害叶片，由基部叶向上部叶发展，初期叶片出现病斑，空气潮湿时叶背产生霜状霉层，有时可延到叶面，后期病斑枯死连片，呈黄褐色，严重时全部外叶枯黄死亡。影响大豆结荚，导致产量降低。
