底肥是施肥中最重要的一个环节，对作物生长发育至关重要。施用底肥需从底肥的种类、数量、肥料品种及施用的深度四个方面考虑。
1.底肥的施用量。确定底肥施用数量尤其是化肥施用量，必须考虑土壤肥力高低。各种肥料作底肥的具体用量可参照当地多年田间肥效试验结果及目标产量等综合因素确定。一般高肥力土壤上氮肥总用量的30%左右底施，中、低肥力土壤则有50%-70%的氮肥作为底肥，而磷、钾肥及微肥尽可能一次全部底施。
2.底肥的施用深度。底肥应施到整个耕层之内，即15-20厘米的深度。对于有机肥、氮肥、钾肥、微肥，可以混合后均匀地撒在地表，随即耕翻入土，做到肥料与全耕层土壤均匀混合，以利于作物不同根系层对养分的吸收利用。磷肥由于移动性差，且施入土壤后易被固定而失去有效性，故在底施时应分上下两层施用，即下层施至15-20厘米的深度，上层施至5厘米左右的深度。上层主要满足作物苗期对磷的需求，下层供应作物生长中、后期的磷素营养。
3.撒施法。在作物播种前，将肥料均匀地撒施于地表，然后翻耕入土。撒施的优点是简便，土壤各部位都有养分被作物吸收；缺点是肥料利用率不高，因为肥料不能全部被作物利用，同时肥育了杂草，水溶性磷肥与土壤过多接触，容易被固定而降低肥效。该施肥方式适用于种植密度较大的作物，如小麦、水稻等。