柑橘主要有柑橘疮痂病、柑橘溃疡病、柑橘炭疽病、柑橘树脂病、红蜘蛛、锈壁虱等病虫害。柑橘疮痂病主要危害叶片、新梢和幼果，叶片易扭曲畸形，新梢则变短小且有扭曲状，果实小且皮厚，可用70%甲基托布津800-1000倍液防治。柑橘溃疡病枝梢会有油渍状小圆点，发病严重时易枯死，可用乙酸铜防治。柑橘树常见的传染性病害主要有黄龙病、溃疡病、衰退病、裂皮病、碎叶病、萎缩病、疮痂病、炭疽病、树脂病、脚腐病，流胶病、烟煤病、苗期立枯病、根结线虫病等。柑橘贮藏期常见的传染性病害主要有绿霉病、青霉病、褐色蒂腐病、黑色蒂腐病、黑腐病、酸腐病等。柑橘常见的非传染性病害主要有缺素症(缺氮、缺钾、缺钙、缺镁、缺硼、缺锌、缺锰、缺铁、缺铜、缺铝)、元素中毒症、自然灾害损伤(水害、旱害、冻害、霜害、冰雹创伤等)、外界环境不适症(如雾害、风害、光害、日灼病、裂果病、枯水病等)。