重病田要实行2-3年轮作，施足腐熟的有机肥，提高植株抗病能力。合理密植，科学浇水，防止大水漫灌，以防病害随水流传播。加强放风，降低湿度。如发现被霜霉病菌侵染的病株，要及时拔除，带出田外烧毁或深埋，同时撒施生石灰处理定植穴，防止病源扩散。收获时，彻底清除残株落叶，并将其带到田外深埋或烧毁。
在发病初期用75%百菌清可湿性粉剂500倍液喷雾，发病较重时用58%甲霜锰锌可湿性粉剂500倍液或69%烯酰锰锌可湿性粉剂800倍液喷雾。隔7天喷一次，连续防治2～3次，可有效控制霜霉病的蔓延。同时，可结合喷洒叶面肥和植物生长调节剂进行防治，效果更佳。加强田间管理，合理密植，实施物理防治，及时清理病株病叶。生物防治相结合，施用高效低毒低残留的生物菌剂。
春菠菜及早秋菠菜应及时拔除系统侵染病株，带出田外深埋；合理密植，加强水肥管理，降低田间湿度。药剂防治可用64%安克锰锌可湿性粉剂1000倍液，或64%杀毒矾可湿性水剂600倍液，或72.2%普力克水剂600倍液进行喷雾，隔6～8天1次，连续（交替使用上述药剂）喷3～4次。
加强栽培管理，合理密植、科学灌水、降低田间湿度。选择抗病品种，可选用萨沃杂交种612号、巴恩蒂、鲍纳斯等名优品种，也可采用尖叶类型品种。在无病地或无病株上采种。如种子带菌，可在播种前用50%福美双可湿性粉剂拌种，用药量为种子重量的0.4%。早春在菠菜田内发现病株，要及时拔除，带出田外烧毁。
在发病初期，喷洒40%乙磷铝可湿性粉200-250倍液，58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液，64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液，或72.2%普力克水剂800倍液，隔7-10天喷一次，连续2-3次。菠菜霜霉病是一种真菌性病害，与种植密度过大、湿度大、播种过早等因素有关。因此种植菠菜应以合理密度适时播种，雨后及时排水，降低田间湿度。如果出现病情，将乙磷铝和高锰酸钾、新高脂膜进行混合，然后喷施治病。