黄瓜霜霉病的防治方法主要以农业防治和化学防治为主。首先选用抗病品种，浸种催芽，培育壮苗；选用健壮无病幼苗，加强栽培管理，科学施肥；最后结合化学药剂进行防治。
合理轮作或间作可有效防治病虫害，且能使土壤肥力被充分利用。耕作深耕可促进植物根系生长发育，增强植物的抗病能力。除草及修剪时将病虫残体和落叶枯枝用火烧毁或深埋，可有效减少第二年病虫害发生率。合理施肥可提高植株抵抗力，减少病虫害发生。
农作物病虫害防治条例(国令第725号)规定，农作物病虫害防治实行预防为主、综合防治的方针，坚持政府主导、属地负责、分类管理、科技支撑、绿色防控。首先要选用抗病优良品种种植；实行轮作，避免连作；适时移植，合理密植；多施腐熟农家肥或生物有机肥等。
防治黄瓜霜霉病时，可使用75%百菌清可湿性粉剂或70%代森锰锌可湿性粉剂喷洒，大概7-10天用药一次，坚持使用3-4次。防治黄瓜白粉病时，可使用50%甲基托布津可湿性粉进行喷洒，同时注意养护环境的透光和通风性，避免湿度过高。
做好水肥管理，根据蔬菜病虫害发生规律及其所需条件，通过分期控制温、光、水、气等环境因素，防治病虫害的发生。农业防治是根据有害生物、作物、环境条件三者之间的关系，通过农业栽培技术措施，有目的地改变农田生态环境，使之有利于作物生长发育和有益生物的增殖，而不利于有害生物的发生为害，从而达到避免或减轻病虫的为害，保护作物增产的目的。这是一种经济、简便、安全、有效的防治方法。
选用无病种薯减少初侵染源。留种田除严格进行化学保护外，还应增高培土，注意排水，防止病菌随雨水渗入土中侵染新薯。在秋收入窖、冬藏查窖、出窖、切块、春化等过程中，每次都要严格剔除病薯，有条件的要建立无病留种地，进行无病留种。