病株的叶片变小，叶脉出现黄条点，以后连成黄绿相间的条纹；心叶变细，抽出后呈淡黄色褪绿畸形叶，心叶被包住，难于伸展，严重时植株明显矮化。病株鳞茎球较小，蒜瓣及须根减少，严重时蒜瓣僵硬，贮藏期尤为明显，大蒜产量和品质明显下降，造成种性退化。
在2～3叶期发病，病株上出现明显的黄色褪绿条斑；成株发病植株呈不同程度的矮化，瘦弱，纤细，叶片无光泽，蜡质消失，呈半卷曲状，有的上下叶片捻在一起卷曲成筒状；心叶不能抽出，病株不能抽薹，薹上具明显的褪绿块斑，病株根短且少，黄褐色。
大蒜叶斑病从苗期至蒜头膨大期均可发病，主要为害叶片，病株先在叶尖出现水浸状暗绿色病斑，之后病斑逐渐向下延伸，使叶片呈鲜黄色，病斑呈黄白色针尖状水渍样褪绿，后变成椭圆形或梭形病斑，平行于叶脉。中央枯黄色，边缘红褐色，外围黄色。在大发生的年份，病斑迅速扩大，造成叶片萎蔫枯黄，蒜株枯死。田间湿度大时，病部产生黑绿色霉状物，重病田整片枯死。遇风雨或浇水后病情快速发展，蒜薹、蒜头产量损失严重。
大蒜花初期蘸上花叶病病的时候就会在叶片上出现小圆斑，这个斑点呈现出花叶病的样子慢慢的逐渐扩张。之后花叶病病会慢慢的延展开涉及到整个植株。大蒜花叶病导致叶片卷缩掉落，新的植株开始扭曲直到萎缩。
