秸秆还田增加土壤有机质和养分含量，湿小麦秸秆内含有丰富的氮、磷、钾、钙、镁等多种营养元素和有机质，含氮量为0.32%，含磷量为0.04。改善土壤物理性状，秸秆还田后经过微生物作用形成的腐植酸与土壤中的钙、镁粘结成腐植酸钙和腐植酸镁，使土壤形成大量的水稳性团粒结构，还田后土壤容重降低，总孔隙增加。提高土壤的生物活性，增加有机质为土壤微生物和动物提供了食物和能量，可以增加其活性，这样可以增加土壤中有效养分的含量。有机质中氨基酸、腐殖酸等大分子物质是一种很好的鳌合物，可以减少被土壤固定的大量及微量元素养分，提高养分利用率。增加土壤中有机质含量，可以提高土壤的缓冲性能，避免连续施用化肥对土壤pH的影响。不过需要注意的是，秸秆还田后，要多施些氮肥，因为微生分解秸秆的同时还需要足够的氮，因为够成微生物本身的除了碳外，还要一定比例的氮。