该病多发生在花期，花球感病后，发病部位先表现水浸状的半透明状，随病情发展，染病处变为褐色软腐，湿度大时可溢出白色菌脓，并散发出恶臭味。主茎或叶柄感病多发生在伤口处，病部开始表现为暗绿色水渍状斑块，后扩展为大型腐烂斑，病组织溃烂，叶柄甚至全株倒塌。花菜软腐病一般发生在生长后期收获之前的块茎上及储藏的块茎上。被侵染的块茎，气孔轻微凹陷，棕色或褐色，周围呈水浸状。在干燥条件下，病斑变硬、变干，坏死组织凹陷。发展到腐烂时，软腐组织呈湿的奶油色或棕褐色，其上有软的颗粒状物。被侵染组织和健康组织界限明显，病斑边缘有褐色或黑色的色素。腐烂早期无气味，二次侵染后有臭气、黏液、黏稠物质。花菜在生长中后期，特别是花球形成增长期间，植株老叶发黄萎垂，细看茎基部出现湿润状淡褐色病斑，中下部包叶在中午似失水状萎蔫，初期早晚尚可恢复，反复数天萎蔫加重就不再能恢复了，查看茎基部的病斑不断扩大逐渐变软腐烂，压之呈粘滑稀泥状；腐烂部位逐渐向上扩展致使部分或整个花球软腐。