西红柿在北方主要有早晚疫病，防治包括在选品种，加强管理，清除病残体，土壤消毒等方面进行，发病时用代森锰锌化学防治。棉铃虫(钻心虫)。幼虫蛀食在花蕾和果实，也蛀食嫩茎、叶和幼芽。可采用药剂防治：2．5%绿色功夫2000倍液或5％菜喜1000倍流48％乐斯本400倍液喷雾防治。生物防治：作物进行套种和轮作。物理防治：利用斑潜蝇的趋黄性，利用黄色粘板诱杀。化学防治：1.8%的阿维菌素800倍液，48%毒死蜱1500倍液，10%的灭蝇胺800倍液。
西红柿的病虫害防治、因地制宜选用商品性好、产量高的抗(耐)病品种，如毛粉802、佳粉17、佳粉10号等。种子处理：利用高温对种子进行处理，杀死表面附着的病原菌。针对当地的主要病害选用下述消毒方法。温汤浸种：把种子放入55℃热水，维持水温均匀浸泡15分钟，主要防治叶霉病、溃疡病、早疫病。磷酸三钠浸种：先用清水浸种3－4小时，再放入10%磷酸三钠溶液中浸泡20分钟，捞出洗净，主要防治病毒病。苗床消毒：用50%多菌灵可湿性粉剂与50%福美双可湿性粉剂按1：1混合，或25%甲霜灵可湿性粉剂与70%代森锰锌可湿性粉剂按9：1混合，按每平方米用药8—10克与15—30公斤细土混合。播种时1/3铺在床面，其余2/3盖在种子上。安装防虫网：棚室的放风口用防虫网封闭，孔径为25－40目，幅宽1－1.2米，覆盖在放风口处。
晚疫病是西红柿的主要病害之一，主要危害叶片和果实。防治方法包括选用抗病品种、合理密植、加强通风、及时清除病株和病叶等。西红柿常见的病虫害很多，但主要是叶霉病、病毒病、晚疫病、蚜虫。在防治方法上，预防为主，综合防治。从选种、苗床消毒、田间管理、化学防治等方面进行了防治。早期发现和预防。在西红柿的种植中，应选用抗病品种，将种子进行消毒处理，可提高植株抗病能力，并根据病情选择达科宁、杜邦克鲁、百菌清等农药进行防治。虫害有蚜虫，白粉虱。西红柿的病虫害，通过选种抗病高产优质品种，做好种子的晾晒和消毒、培育无病虫害壮苗，合理轮作倒茬、建立科学合理的耕作制度，加强田间管理、防止田间积水、控制田间湿度，根据病虫害发生种类和严重程度，有针对性地采取相应措施，选择对症的高效低毒低残留农药在田间进行交替喷雾开展病虫害绿色标准化防治。农业防治法如秋翻冬灌，轮作倒茬。物理防治如杀虫、诱杀。生物防治如释放赤眼蜂，瓢虫。化学防治如打药，灌根。
西红柿种植过程中应该加强田间管理。要注意防止干枯霉霜病和蚜虫病发生。主要是轮作倒茬，杀虫，消毒。加强田间管理。监测病虫害发生。棉铃虫：翻耕土地，浇水淹地，减少虫源。瓜绢螟：在幼虫发生初期，及时摘除卷叶，提倡采用防虫网。白粉虱：用2.5%溴氰菊酯乳油2000-3000倍液进行喷雾防治。灰霉病棚室种植的番茄发病重。适当增施磷钾肥，提高植株抗病能力。采用滴灌、膜下暗灌技术，防止大水漫灌。发病初期及时摘除残留花瓣及柱头,清除病叶、病果，拔除病株，防止病害蔓延。番茄的虫害和防治方法包括药剂防治和化学防治。其中，化学防治是指使用农药或化学剂类防治病虫害，如杀灭菊酯、敌杀死、氰戊菊酯等。在幼虫1-3龄时，喷洒不同的药剂防治。药剂防治还包括预测预报、架设频振式或微电脑自控灭虫灯等方法。在用药时期，喷洒不同的药剂防治。
大棚秋茬种植西红柿容易出现的病虫害有，前期病毒病较为常发，后期叶霉病、早疫病、晚疫病等病害较重，虫害主要防治蚜虫、白粉虱和棉铃虫等害虫。虫害主要有蚜虫、白粉虱等。防治方法。用粘虫黄板诱杀。用10％的吡虫啉可湿性粉剂1500倍液或25％阿克泰水分散粒剂喷雾防治，每亩用5g。主要以预防为主，综合防治。加强田间管理，合理间作，药物防治，霜霉病，75%百菌清喷雾。蚜虫，白粉虱用20%啶虫脒喷雾。选用抗病虫品种，轮作倒茬，采取适时播种，合理密植、配方施肥、及时除草，病虫害以预防为主，加强大棚内的通风透气，高温季节降低棚内温湿度，发生期进行药剂防控。番茄叶霉病防治方法：播种前对种子进行消毒。发病前后可用70%代森锰锌可湿性粉剂500倍稀释液，或50%速克灵可湿性粉剂800~1000倍稀释液喷防，每7d喷1次，连喷3~4次。合理肥水，增施有机肥，培育壮苗，提高植株自身抵抗力。去除杂草，及时整枝打叉，合理利用光照，增加通风透光。适时喷施药剂，综合防治病虫害。
病因：直接原因是子房心室过多，子房心室过多的原因包括：苗期低温。特别是2-5片真叶时，夜间低于8℃，白天低于20℃；苗期赤霉素、乙烯利等激素过量施用；氮、磷营养过剩；品种差异。有些品种在子房心室形成时易受环境影响。在防病方面主要注意几方面，选择抗病品种，合理施肥，科学管理，以预防为主的原则，早发现早治疗。在防虫方面首先要采用物理和化学方法相结合进行防治。红柿灰霉病属真菌类半知菌，病菌先浸染花及花柱，然后传染叶片及果实，叶片病菌先从叶尖开始发病呈三角形往里浸入发展，病斑黑褐色，长黑毛，果实发病先从果柄处腐烂产生黑毛。灰霉病是继晚疫病后第二大病害，阴雨天、温度低棚内湿度大露水多发病重，要及时通风排湿，防治灰病害可用腐霉利600倍或美无痕600倍喷雾防治，烟雾剂可用灰霉斯烟剂熏棚。防治方法：防治青枯病可以选择抗病的品种，加强肥水管理，或用77%悬浮800倍液浸灌水防治；防治病毒性病害可用10%硝酸钠浸种或者硫酸锌1000倍液等药剂喷施；防治晚疫病要提高植株的抗逆性，或使用72%霜霉病净润湿粉稀释800倍药剂喷洒。
