施肥不当、生长衰弱、土壤偏碱等因素易导致菠菜心腐病发生。该病主要由土地长期潮湿、偏酸性或病菌残留引发。地势低洼、土壤排水不畅、根系受伤、土壤盐分重、种植密度过大、肥水不足、植物生长势弱等条件均有利于发病。病菌以菌丝体和分生孢子器随病残体在土壤中越冬，翌年条件适宜时产生分生孢子或游动孢子，借风雨传播为害。
菠菜心腐病的发病条件包括：1、土壤或种子带菌，病菌随风雨传播为害；2、地势低洼、排水不良，发病条件适宜；3、管理粗放，植株长势较弱、抗病力较差。种子带菌的菠菜发芽后未出土即可发病，出土后幼苗茎基变褐、缢缩，导致猝倒或腐烂，造成缺苗断垅。较大苗受害时，根茎处变褐坏死，植株外叶黄化，心叶坏死，或半边黄化半边坏死，最后腐烂。病茎基部产生不明显的小黑点。病菌在种子或病残体上越冬，来年随气流、风雨、灌溉水、昆虫及农事操作传播蔓延。长势弱、贫瘠地块、低洼易涝、密度大的地块易发病。
真菌引起的病害，病菌随病残体留在土壤中或附着在种子上越冬，借风雨或灌溉水传播。施肥不当、生长衰弱、土壤偏碱等发病重。
