红薯常见的病害有黑斑病、红薯茎线虫病及红薯根腐病。病害防治按照“预防为主，综合防治”的方针，坚持“农业防治、物理防治、生物防治为主，化学防治为辅”的无公害化治理原则。主要病害包括病毒病、叶斑病、疮痂病、红薯瘟、红薯蔓割病、红薯软腐病等。防治方法首先是采用脱毒苗、对种苗消毒；其次是根据不同病害进行药剂防治。对于生理性病害的控制和防治，需注意土壤缺素、生理性缺素、环境不良等因素引起的缺素症、日灼、老化、弱小、萎蔫等病害。
主要虫害有茎螟、天蛾、卷叶螟、叶甲、小蟓甲、金针虫、金龟子、蝼蛄、地老虎、斜纹夜蛾、蚜虫和白粉虱等。轮作方面，水田可实行水旱轮作，早茬种水稻秋种红薯或晚茬种水稻冬种红薯；或春夏季种水生蔬菜秋冬季种红薯。采用组培脱毒育苗方式，每20000平方米安装一盏频振式诱虫灯进行灯光杀虫。
红薯害分地下部分和地上部分，地下应防治好象甲虫与软腐病、根腐病；地上部分应防好菜青虫、蝶类幼虫等病虫害，做到以防为主、上下结合统筹防治。红薯主要病害及其防治中，红薯黑斑病在红薯的整个生长储藏阶段都有可能发病，主要危害红薯的苗和块，对藤蔓部分无危害。常见且为害严重的病害有病毒病、黑斑病、软腐病；常见且为害严重的虫害有红蜘蛛、甘薯天蛾、甘薯麦蛾、线虫、蛴螬、地老虎等。
