藤椒和花椒在植物科属、外观、香味味道和用途等方面存在明显的区别。藤椒，属于芸香科柑橘属，具有酸辣和苦涩的味道，主要用于制作调味料和药物。其树形低矮，树枝紧凑，枝叶细小，叶片较薄，多为羽状复叶。藤椒的果实颗粒小，果色为绿色，有光泽，香味清香，麻味不及花椒强烈且无青花椒的苦涩味。
花椒是芸香科花椒属植物，其香味浓烈，麻味比藤椒要强但比麻椒温和，主要用于烹饪调味。花椒树形较大，枝叶松散，树枝粗壮，叶片较厚。花椒的果实颜色多样，包括绿色的青花椒和暗红色的花椒。
在烹饪或药物应用时，需要根据其特点和需求选择合适的植物，并注意适量使用，以充分发挥其独特的风味和功效。此外，藤椒结籽方式似葡萄，是一串串的，而花椒则是一攥一攥的。