由真菌引起，具有传染性。一年生嫩枝染病后当年形成瘤状突起，下年5月病斑扩大，病体开裂溢出树脂，起初为无色半透明软胶，以后变为茶褐色结晶状；多年生枝染病，会产生水泡状隆起并有树胶流出。花椒树流胶病的发病原因主要有以下几点：①粗放管理，偏施氮肥，土壤酸化、板结，导致树体衰弱，强旺树一般很少有流胶病的发生。②虫害，如天牛、吉丁虫，田间作业不当，碰伤、机械损伤、冻伤、剪锯口等伤口感染病菌，引起花椒树流胶病的发生。③6月份病菌产生分生孢子，借风、雨传播蔓延，并通过伤口入侵，弱树易感染。感染后在当年或来年发病。每年有两个发病高峰期，分别是5-6月份和8-9月份。高温高湿、空气湿度大时发病重。发病初期，枝杆上病处有透明软胶，逐渐变为红褐色胶体结晶，雨水多时流胶也多。随病菌的侵害，受害部位扩大，最后导致枝干死亡。
导致流胶病的发生有两个方面：一是受真菌侵染，枝干受害后，会形成瘤状凸起，之后树皮开裂溢出树脂，造成流胶，随着病菌侵染，受害部位细胞坏死，导致枝干枯死。同时溢出的胶体中含有大量的病菌，胶体随枝流下会导致根茎受病菌侵染。病菌形成的孢子在病枝里越冬，第二年春季3-4月份时开始活跃，随气温升高而加速蔓延，一年有两次高峰，分别是5-6月和8-9月。二是机械损伤、虫害、冻害等造成伤口，从而发生流胶。尤其是在早春树叶流动时，由于存在根压，常发生此类流胶，流出的胶体都是树体合成的营养成分，易被腐菌浸染，导致枝干腐烂的发生。
此外，土壤粘重导致植物根系生长不良，吸收养分能力弱，从而造成树体生长势不良；偏施氮肥导致树体虚旺，细胞不紧密，树体营养不足，抗病性差。同时偏施氮肥也会造成土壤板结、酸化，土壤中有益微生物活性降低，从而影响树体的生长势。花椒流胶病在高温高湿环境下发病重，除了真菌侵染和存在伤口（人为操作不当、虫害、恶劣天气）两方面原因外，树势弱、树龄大；施肥不科学，氮肥过多，中微量元素不足；高温高湿，雨水多；修剪不当，通风透光不良；土壤板结、黏重等都易引起流胶病。具体原因包括：1、造成伤口：农事操作、虫蛀、自然风雨等造成树体伤口，树液从伤口流出，病菌趁机侵染繁殖，进而造成流胶病的发生。2、冻害。3、树体储备营养不足。4、土壤不良。5、偏施氮肥。