床土消毒应选用无病新土。加强苗床管理,选择地势高、地下水位低、排水良好的地做苗床。育苗畦(床)及时放风、降湿,即使阴天也要适时适量放风排湿,严防幼苗徒长染病。种植抗病品种、种子包衣和清理田间病残体是防治胡萝卜黑腐病的有效方式。胡萝卜生育期叶片发生黑腐病不仅造成产量损失,而且可为贮藏期肉质根发病积累足量的病原,同时也为侵染胡萝卜根冠部提供通道,因此叶片发病初期进行化学防治是控制病害的重要手段。贮藏前,清洗并剔除带伤胡萝卜,使胡萝卜损害程度降到最低,可降低贮藏期胡萝卜黑腐病发生几率。贮藏时保持适当的温度(0℃左右)和湿度(小于92%)可阻止胡萝卜受侵染和降低病害蔓延几率,收获后贮藏的卫生条件对控制病害至关重要。