胡萝卜黑腐病是由胡萝卜黑腐交链孢引起的病害，可发生在胡萝卜的整个生长期，危害叶片、茎及肉质根等。叶片发病呈暗褐色斑，严重时枯死。茎、叶柄发病呈梭形或长条形斑，湿度大时产生黑色霉层。肉质根发病在根头部形成凹陷黑斑，严重时肉质根腐烂。
环境因素对胡萝卜黑腐病的发生有重要影响。土壤温度过高（适宜温度为20-25℃）会导致病原菌大量繁殖，使胡萝卜易受感染。湿度过大是主要因素之一，土壤水分过多会导致胡萝卜根系长期处于潮湿环境下，促进病原菌的生长和传播。土壤过肥会使胡萝卜长势过旺，容易成为病菌的宿主。高温多雨的环境下，病害发生较为严重。
病原菌主要包括腐霉菌和假单胞菌。腐霉菌是主要病原菌，越冬在土壤中，一般在春季或早夏季开始侵染胡萝卜。假单胞菌主要通过土壤和污染的种子传播。
宿主植物胡萝卜本身也是重要因素。如果胡萝卜没有得到充分的营养和生长条件，植株就会变得虚弱，难以抵御病原菌的入侵。
黑腐病是一种细菌性维管束病害，病原细菌在种子或土壤里及病残体上越冬，气温在15℃~21℃时，危害严重。播种偏早，苗期多雨，地势低洼，浇水过多，和十字花科蔬菜连作，中耕施肥时伤根以及虫害严重的地块，发病都较重。暴风雨有利于病菌的传播，并使叶片因碰撞而产生伤口，故能加重发病。贮藏期高温，能使病害加剧发展。
病原菌在土壤中的病残体或者种子中越冬，传播途径比较多，可以借助雨水飞溅传播、昆虫活动传播、田间灌溉等农事操作传播。
