甘蔗锈病发生与温湿度有密切的关系。高温不利夏孢子存活萌发，病菌孢子必须与水膜接触才能萌发，孢子堆的形成也需要较高的相对湿度。长期阴雨、露水重、日照少、温凉的条件下容易发生流行。甘蔗得不到合理轮作，使田间菌源大量积累，反复侵染，流行速度加快；地块长期种植，地力下降，栽培管理上注重偏施氮肥，造成缺磷少钾，引起蔗叶组织柔嫩，叶色浓绿，容易诱发病害。
不同甘蔗品种对锈病的抗病力差异很大。秋植蔗最重，冬植蔗次之，春植蔗最轻。土壤贫瘠、甘蔗生长较差的田块发病较重。甘蔗锈病发生与温度关系密切，气温16～22℃发生最多。锈病发生和温度、湿度有密切关系，平均温度大约在18~26℃易发生流行。但高温不利于夏孢子存活萌发，病菌孢子必须与水膜接触才能萌发，孢子堆的形成也需要较高的相对湿度。雨多、露水重、湿度大，病害容易发生流行。管理不善、土壤贫瘠、甘蔗生长较差的田块锈病发生较重。
冷凉多湿的天气，容易发生流行，主要发生在每年的11月至次年的5月，6月以后，温度过高，甘蔗植株一般不再受侵染。不同植期甘蔗发病的程度：秋植重于冬春植。
