南瓜常见病害包括细菌性缘枯病、白粉病、疫病、炭疽病、霜霉病、病毒病、斑点病、黑斑病、枯萎病、黑星病、根腐病、褐斑病、霉腐病、灰霉病、软腐病、疮痂病等。主要虫害有蚜虫、黄虫、瓜蝇、夜蛾、小地老虎、蓟马、黄守瓜、美洲斑潜蝇、棉铃虫、地下害虫等。