病菌随病残体在土中越冬。春天病菌借雨水溅射传播，发病初期叶斑呈圆形至近圆形或不定形。叶缘黑褐色，病健部交界处呈湿润状，湿度大时斑面密生小黑点，严重的叶斑融合，致叶片局部枯死。花轴或花染病呈黑色湿润状，或呈黑褐色腐烂。侵染南瓜，导致南瓜斑点病的病原真凶主要是半知菌亚门真菌中的正圆叶点霉。真菌中的瓜角斑壳针孢也可以侵染南瓜，并引起同样的症状。
在高温多雨的气候条件下，病原菌以分生孢子的形式在土壤中生活，借着雨水传播并侵染南瓜。南瓜种植在地势低洼、潮湿的地方，或种植密度过大，导致阳光不能照射到土壤，南瓜之间透气性差，缺乏阳光和空气流通，也易出现南瓜斑点病。气候环境、栽培管理等因素与南瓜褐斑病的发生、流行密切相关。保护地栽培中高温高湿、通风不良，露地栽培中雨水较多、管理不善、缺水缺肥、长势较差、偏施氮肥、植株徒长，都容易引起发病。
高温多湿的天气是南瓜斑点病发病的重要条件，多始见于高温多湿季节。地势低洼或株间郁闭，发病重。分生孢子进行初侵染和再侵染，借雨水溅射传播。该病华南始见于5月后的高温多湿季节，北方多见于八、九月份。连作导致土壤病残体带菌，高温高湿利于病菌侵染发病，枝叶过密徒长，荫蔽有利病菌侵染发病。
