番茄筋腐病的发生与土壤水分有密切的关系，灌水多和地下水位高的土壤发病较重。施肥量大，特别是氨态氮肥施用过多时，影响磷、钾肥的吸收，发病较重。施用未腐熟的农家肥、密植、强行摘心等，都很容易发病。同时发病与品种有很大的关系。
番茄筋腐病，是一种类似番茄病毒病的免疫性生理病害，多在转色期发现，表现为果实僵果不转色，剥开表皮可看到发黑的筋。病害发生是由于土壤中氮肥过多，氮、磷、钾比例失调，土壤含水量高，施用未腐熟的人粪尿，光照不足，温度偏低，二氧化碳量不足，新陈代谢失常，维管束木质化而诱发筋腐病发生。植株结果期间低温光照差，植株对养分吸收能力差，影响光合产物积累，易发牛筋腐病。土壤板结，通透性差，妨碍根系吸收养分和水分，筋腐病重。另外，冬天气温较高，昼夜温差小也易诱导筋腐病。一般情况下，叶量大，生长势强的品种，病轻或不发病。
褐色筋腐病多发生在低温弱光之下，植株茂密通透不良更利于本病发生。越冬栽培一定要密度合理，同时要合理整枝，改善株间透光性。土壤水分过大，土壤氧气供应不足时，有利于本病发生。施肥量过大，特别是氨态氮施用过多，钾肥不足或钾的吸收受阻时，本病发生也重。施用未经充分腐熟的农家肥、密植、小苗定植、强摘心都可能诱发本病。
白变型筋腐病和烟草花叶病感染有关。应选用抗这一病毒的品种。多数认为是碳、氮代谢紊乱所致，大致可分为光合作用降低、氮素同化能力增加及缺钾造成的糖分分解系统不正常，使碳/氮比下降。
