西红柿是连续成长成果的蔬菜，除基肥外，还需施好追肥。第一次追肥在定植后，结合缓苗水进行催苗肥，可使用人粪尿、硫酸铵、尿素等，数量约占全期追肥总量的20%。蹲苗结束至第一穗果实膨大时，进行第二次追肥，这是重点时期，量约占全期追肥量的40%，可使用硫酸铵、尿素、碳铵、人粪尿、过磷酸钙、钾肥等。为促进第二三穗果实成长并防止秧苗早衰，进行第三次追肥，数量占全期追肥总量的20%。第二穗果实成熟、第三四穗果实迅速成长时，进行第四次追肥。若土壤肥力不足或基肥施用量偏低，秧苗生长缓慢，可依据实际情况进行第五、六次追肥。
施肥方式包括基肥和追肥。复合肥撒地深翻入土，水溶肥可通过滴灌、漫灌、喷灌、冲施等方式施用。番茄种植前需撒基肥，生根期若生根不良可追施福进门促生根专用水溶肥，膨果期也有专用肥料。无论是露地或保护地栽培的西红柿，常因施肥时间不当导致缺磷缺钾，出现植株衰弱、结果畸形等症状，影响产量和品质。因此，在西红柿的整个生长期，应根据其生长特点，在定植期、壮秧期和结果期适时施肥，以确保优质高产。
