螨虫、蓟马、白粉虱、蚜虫与鳞翅目害虫是辣椒常见的害虫。针对白粉虱和蚜虫,可使用呋虫胺、唏啶虫胺、吡蚜酮进行防治;针对螨虫和鳞翅目害虫,可选用阿维菌素、哒螨灵、甲维·茚虫威、虱螨脲、联苯·乙螨唑;针对蓟马,可使用乙基多杀菌素、多杀霉素、螺虫乙酯。生物防治方法包括利用草蛉、七星瓢虫等天敌,以及生物或其代谢产物,实现以虫治虫、以菌治虫、以菌治菌。辣椒常见的病虫害包括辣椒疫病、病毒病、黑根腐病、菌核病、蚜虫、白粉虱、烟青虫、茶黄螨、红蜘蛛、地老虎、蓟马等。主要病虫害有青枯病、疫病、白粉病、软腐病、茶黄螨、立枯病、猝倒病、炭疽病、烟青虫、棉铃虫和蚜虫等。