芝麻在播种期发生旱灾，会造成种子无法出苗，即使出苗了也会造成出苗不齐或苗期生长不良等问题。生育期遇持续干旱，往往会造成芝麻生长发育迟缓，叶片萎缩蔫黄脱落，后期叶片早衰，危害极大。开花期干旱，会造成开花结蒴减少、花蕾脱落，植株矮小，产量降低，品质下降，一般干旱能减产10%-30%，受旱严重的减产可达50%以上。
预防措施包括建立健全的农田水利保障系统，实现旱能灌、涝能排、渍能降，结合当地实际情况，发展滴灌或喷灌等节水灌溉技术。种植时应选择耐旱性强的品种，一般单杆型品种比分枝型品种耐旱性强，茸片少的比茸片多的耐旱性强。芝麻忌连作，选地时应注意选择肥水条件优良且三年以上未种植过芝麻的地块。在干旱发生频繁、持续时间长的地区，可以采取秋翻地做垄、春耙压的整地措施，适时适墒播种，减少旱灾带来的影响。培育幼苗时要加强苗期管理，及时间苗，培育壮苗。大田栽培时，一旦发现有干旱迹象，及早浅中耕，行间加盖秸秆、地膜等抗旱覆盖物，减少水分蒸发。
