内因：品种差异、品种自身退化、引种不当。例如，由于对大豆品种的光照和温度敏感性不了解，盲目提早或推迟播种，或盲目异地引种，容易发生大豆不开花、只开花不结荚或提早开花结荚等不正常现象。种植的是自己留的种子，由于没有精捡，大小不一，杂质多，机播时种子受到损伤，都会对结荚造成一定影响。不适合本区域种植的品种，如南方品种在北方种植，东方品种在西方种植，因大豆是短日照作物，条件不满足时也会出现不结荚的情况。
外因：温度过高或过低、降雨过少或过多、栽培措施不当、营养成分缺乏或不均衡、病虫危害。大豆开花授粉的适宜温度为20～25℃，超过35℃雄蕊会死亡，适宜相对湿度为70～90%。花期高温干旱会导致花粉失活或柱头不吸附花粉，生理性缺硼影响受精结实。连阴雨会导致花粉破裂，丧失活力。持续高温干旱天气会使植株呼吸过旺，减少干物质积累，影响开花授粉，导致胚珠败育形成秕荚。此外，大豆种植过密、氮肥施用过多、病虫害危害等也会影响结荚。