青霉是最易发生的丝状菌，发育适温30℃—35℃，但在20℃左右也长得很好。青霉开始蔓延时和金针菌丝相似，随着逐渐成熟长出青色孢子。曲霉开始繁殖时是白色菌丝，成熟后着生黄绿色孢子，发育适温是30℃左右。栽培室在堆肥附近，或曾放过菌种，或附近有制曲厂都易生长曲霉。一旦发生曲霉，会使菌种污染而全部覆灭。大毛霉和曲霉相似，繁殖力强，在培养基内部蔓延，生成白色或灰黑色蜘蛛丝样的菌丝，产生黑色抱子，发育适温35℃左右。毛霉和大毛霉一样，繁殖力旺盛，在高温下发育。选用抗病的金针菇品种；合理调控菇房温湿度，出菇期间菇房温度应控制在15℃以下，合理安排栽培季节，南方要使子实体发生期在3月底以前结束，以避开春季高温、高湿的影响；及时防治害虫，特别是刺吸式口器的昆虫；发病初期可用漂白粉或漂粉精兑水喷雾(溶液内含有效氯1%—1·5%)金针菇。