辣椒根腐病主要危害辣椒根茎部及维管束，由腐皮镰孢霉等引起。发病初始，病株枝叶特别是顶部叶片稍见萎蔫，傍晚至次日早晨恢复；发病中期，病株初期症状反复2-4天后，顶部叶片无法恢复，萎蔫症状向中下部扩散，再经2-3天，全株叶片全部萎蔫，但叶片仍呈绿色；发病后期，病株的根茎部呈淡褐色或深褐色腐烂，可见维管束变褐色，潮湿时病部长出白色至粉红色黏质物。
低垄栽培、定植密度大或与茄果类蔬菜连作，发病较重。灌水方式、灌水量、灌水时间与发病有直接关系，如采用水肥软管一体化浇灌发病较轻，大水漫灌发病重，晴天上午浇灌发病轻，阴雨天大水漫灌发病重。病菌以厚垣孢子、菌核或菌丝体在土壤中越冬，成为翌年主要初侵染源，通过雨水或灌溉水传播和蔓延。
发病原因包括施用未腐熟有机肥、施肥过量过近根部、田间排水困难、湿度过大透气不良等。病菌从根部伤口侵入，后在病部产生分生孢子，借雨水、灌溉水传播，进行再侵染。辣椒根腐病是辣椒常见病害，露地栽培、保护地栽培均可发病，春季多雨、梅雨期间多雨的年份发病严重，常造成根系腐烂、植株枯死。地势低洼、排水不良、田间积水、连作及棚内滴水漏水、植株根部受伤的田块发病严重。
