灵芝菌丝生长期要求空气相对湿度为70%～80%，子实体发育期则需90%～95%。若湿度低于80%，子实体生长质量不良，菌盖边缘的幼嫩生长点会变暗灰色或暗褐色。菌丝生长期，培养料含水量以55%～60%为宜，空气相对湿度为65%～70%。子实体发育期，培养料含水量可达60%～65%，空气相对湿度需达到90%～95%，以促进菌丝生长旺盛，速度快且菌盖大。菌丝生长所需水分来自基质，只要空气中相对湿度维持在70%左右，能保证基质中水分不因空气干燥而蒸发即可。若相对湿度低于70%，需向基质及空气中补充水分；高于80%，则需通风降低空气湿度，以保证基质中有足够的氧气。子实体生长阶段，要求空气相对湿度保持在85%～90%之间。若相对湿度低于60%，子实体形成缓慢或停止；低于45%，菌丝生长停止，已形成的幼小子实体会干死；高于95%，由于空气中氧气含量降低，呼吸作用受阻，导致菌丝及子实体的窒息，引起菌丝自溶和子实体的腐烂、死亡。适宜相对湿度为90%-95%，并要求从原基出现到子实体成熟，保持湿度相对恒定不变，以促进子实体正常均衡生长。