西红柿筋腐病主要发生在果实膨大至成熟期，症状表现为果实着色不均匀，有绿有红，形成“花皮果”。病果外形完好，但表皮下组织部分呈暗褐色，逐渐出现自果蒂向果脐的条状灰色污斑，严重时呈云雾状。后期病部颜色加深，病健部界限明显，果实横切可见维管束变褐，细胞坏死，严重时果肉褐色，木栓化，纵切可见白果柄向果脐有一道道黑筋，部分果实形成空洞。
筋腐病分为褐变型和白变型。褐变型主要危害1-2穗果，幼果期开始发生，剖开病果可见果皮里的维管束呈茶褐色条状坏死、果心变硬或果皮变褐。白变型主要发生在绿熟果转红的时期，病症是果实着色不均匀，轻的果形变化不大，重的靠近果柄的部位出现绿色突起状，变红的部位稍凹陷，病部有蜡状光泽，剖开病果可发现果肉呈“糠心”状，果肉维管束组织呈黑褐色，轻的部分维管束变褐坏死，且变褐部位不变红，果肉硬化，品质差，食之淡而无味。发病重的果实，果肉维管束全部呈黑褐色，部分果实形成空洞，明面红绿不均。
筋腐病与病毒病的区别在于，筋腐病病果病部表皮不变色，病害由果内向外发展，而病毒病病果病部表皮变褐色，由外向内发展，果肉变褐色。
