大豆秕粒的主要原因是叶片功能衰退或营养生长过旺，导致光合产物不足或运送到种子内的物质较少；缺乏水分供应或供应不足；高温干旱影响营养物质的运输；以及病虫害侵害，如大豆感染病毒后产生青棵不实。因此，后期田间管理需注意防止病虫害，根据气候和土壤水分状况及时灌溉和排涝，并补充养分。
大豆开花结荚、籽粒形成期是需肥高峰期，应及时补充养分，可采用叶面喷肥方法，每亩用磷酸二氢钾200克、钼酸铵50克，兑水50―60公斤均匀喷洒叶面，能增产10%以上。大豆秕粒还因叶片功能衰退、光合作用合成养分减少，或缺乏水分阻碍营养运输，导致豆粒营养不足。此外，土壤肥沃疏松、底肥充足可能导致前期生长过旺、徒长或倒伏，进而引发后期秕粒，病虫害也会导致秕粒。
预防措施包括：1、选用适宜品种，提高种子纯度；2、调整种植结构，合理安排茬口；3、适时早播，合理密植；4、科学施肥，保持营养均衡；5、合理灌溉，及时防旱排涝。
