向日葵黄萎病的防治应结合抗病品种、农业措施和化学药剂,以取得最佳效果。病菌在土壤、病残株和种子中越冬,种子带菌率低且仅存在于果皮上,胚和胚乳无病菌。播种后病菌通过直接或伤口侵入幼苗根部,导致发病,潜育期随温度和生育期变化,通常为7天。