黄萎病可用中生霉素、腐殖酸铜、春雷霉素、乙蒜素、多抗霉素、嘧菌酯、恶毒灵、咪鲜胺、克黄枯、三氯异氰尿酸、甲托等交替使用防治。间隔5-7天一次，连续2-3次。
1.与葱、蒜等非茄科作物实行轮作5年以上，与水田轮作1年即很有效。
2.选用耐病茄子品种，如齐茄1号、海茄、辽茄3号等。播种前用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液浸种1小时，然后用流水冲洗20～30分钟。或用55℃热水浸种15分钟，移入冷水中冷却后催芽播种。
3.无菌土育苗，或在播种时，每平方米用50％多菌灵可湿性粉剂10～15克均匀撒在床面，与5厘米深床土拌匀后播种。
4.夏季高温季节，先将田块表土层耕翻耙碎并喷水至湿润，用无色透明塑料薄膜覆盖严实，设施栽培可同期密闭棚室15天以上。对于发病严重的田块可考虑太阳光高温消毒与化学药剂熏蒸结合使用。
5.茄子黄萎病发病初期，及时使用药剂防治，药剂可用：50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂1000倍液灌根，每隔5~7天灌1次，连灌2~3次。
6.选用抗病品种如长茄1号、黑又亮、长野郎、冈山早茄、吉茄1号、辽茄3号、长茄3号、鲁茄1号等。
7.选择地势平坦、排水良好的砂壤土地块种植茄子，并深翻平整。发现过黄萎病的地块，要与非茄科作物轮作4年以上，其中以与葱蒜类轮作效果较好。
8.防治茄子黄萎病，用0.5%氨基寡糖素水剂200~300倍液，在苗期喷一次，重点为根部，定植后发病前或发病初期灌根，每株灌100~150毫升，隔7~10天灌一次，连续灌根3次。
9.选用无病种子或种子处理，从无病株上留种。
10. 农业防治：实行轮茬作业3～4年；无病土育苗；施足腐熟有机基肥，增施磷钾肥；发现病株及时拔除，收获后彻底清除田间病残体烧毁。
11. 嫁接换根：栽培茄作接穗，采用劈接法嫁接，可收到95%以上的防效。嫁接时必需用无菌土培育接穗，防止接穗带菌，否则影响防效。
