耕层浅是小麦发黄的原因之一。秸秆还田虽然提高了土壤肥力，但玉米秸秆还田量大，耕层通常不足20厘米，导致小麦难以扎根，养分供给不足，长期下来出现黄化现象。建议小麦种植户在种植时切碎后镇压保墒，防止中空。已经耕种的小麦要及时补施氮肥，最好在年前进行。
缺氮或缺磷也会导致小麦发黄。小麦缺氮型发黄通常由于播种过早、基肥施得不足或基肥中含氮量低引起。病害如小麦根腐病、纹枯病、全蚀病，以及虫害如苗期蚜虫、红蜘蛛，都会导致小麦叶片发黄。此外，播种过深或过浅也会造成苗黄弱，播种过浅分蘖节裸露，次生根少而短，冬季温度高，土壤塇松，麦田失墒快，表墒不足，根系吸收水分养分困难，下部叶片及叶尖发黄较重。
