主要为害叶片，也为害叶鞘和苞叶。常从下部叶片开始发病，逐渐向中上部叶片蔓延。发病初期，在叶片上出现半透明、水渍状褐色小斑点，后扩大为受叶脉限制的椭圆形、圆形或长圆形病斑，红褐色或黄褐色，边缘色泽较深，赤褐色，轮廓清楚，有时有二、三个同心轮纹。病斑进一步发展时，内部略褪色，后渐变为暗褐色。天气潮湿时，病斑上生出暗黑色霉状物（即分生孢子盘）。在抗病品种上则表现为边缘紫褪色或深褪色点状黄褐色病斑，周围有褪绿晕圈。
玉米小斑病在玉米整个生育期内都可发生，但以抽雄、灌浆期发病严重。主要为害叶片，但叶鞘、苞叶和果穗也能受害。在叶片上病斑较小，病斑数量多，在高温多湿条件下，病斑表面密生一层灰色的霉状物，即病原菌分生孢子梗和分生孢子。因玉米品种和病原菌生理小种不同，而表现为三种不同病斑类型：一是病斑椭圆形或近长方形，多限于叶脉之间，黄褐色，边缘褐色或紫褐色，多数病斑连片以后，病叶变黄枯死；二是病斑椭圆形或纺锤形，较大，不受叶脉限制，灰色或黄褐色，边缘褐色或无明显边缘，有的后期稍有轮纹，苗期发病时，病斑周围或两端形成暗绿色浸润区，病斑数量多时，叶片很快萎蔫死亡；三是病斑为黄褐色坏死小斑点，病斑一般不扩大，周围有黄色晕圈，表面霉层极少，通常多在抗病品种上出现。
叶鞘和苞叶上病斑较大，纺锤型，黄褐色，边缘紫色或不明显，表面密生灰黑色霉层。果穗受害时，病部为不规则的灰黑色霉区，严重时，引起果穗腐烂，下垂掉落，种子发黑腐烂，影响发芽和出苗，常导致幼苗枯死。此病除危害叶片、苞叶和叶鞘外，对雌穗和茎秆的致病力也比较强，可造成果穗腐烂和茎秆断折。其发病时间，比大斑病稍早。发病初期，在叶片上出现半透明水渍状褐色小斑点，后扩大为5-162-4毫米大小的椭圆形褐色病斑，边缘赤褐色，轮廓清楚，上有二、三层同心轮纹。病斑进一步发展时，内部略褪色，后渐变为暗褐色。天气潮湿时，病斑上生出暗黑色霉状物（分生孢子盘）。叶片被害后，使叶绿组织常受损，影响光合机能，导致减产。
