菠菜霜霉病主要危害叶片。叶片染病通常从贴地面的下部叶片开始发生，并逐渐向上发展。发病初始产生淡黄色小点，扩大后病斑呈不规则形，边缘不明显，病叶背面病部产生一层霜霉层，即病菌的孢子囊和孢子囊梗，霉层初为灰白色后成灰紫色。病斑发展到中、后期变为黄褐色枯斑，干旱时病叶枯黄，潮湿时变褐、腐烂。发病严重时，病斑相互连接成片，色泽呈枯黄色至褐色，使病株大部分叶片变黄枯死。
菠菜霜霉病在低温高湿环境下发病严重，有时甚至绝收。夜间有露水时易发病。多湿时病叶腐烂，严重时叶片全部变黄枯死。由种子带菌引起的初侵染，病株表现为萎缩状，新叶变小，变脆，潮湿时其上密生霉层，可归为冬前原生性系统侵染所致。
病菌以菌丝体随病株残余组织遗留在田间越冬或越夏，也能以菌丝体潜伏在种子内越冬或越夏。翌年春，在环境条件适宜时，菌丝体产生分生孢子，通过风和雨水反溅传播，或中管棚和连栋大棚保护地棚内浇水反溅至菠菜叶片上，从寄主叶片气孔或表皮直接侵入，引起初次侵染。
