2~3月春梢萌动时进行第1次施肥,根据树势强弱补施速效氮肥,弱材、花量多的树适当多施;强材、花量少的树少施或不施,氮肥用量占全年总量的10~15%,促春梢健壮生长。第2次施肥在谢花后至果实膨大前,结合保果、治虫,多次喷施0.3%尿素液,补充开花后树体养分损失,增加着果量。第3次施肥在7~8月秋梢抽发、果实膨大期,施肥量较大,氮肥占全年用量的40%,磷、钾肥各占50%,在每株滴水线处开施肥坑2个,深30~40厘米,确保秋梢母枝健壮,春花分化良好。第4次施肥在11月采果后、气温降低前,重施深施,在秋季施肥的另两侧深挖坑,施氮肥量占全年用量的40%,磷、钾肥各占40%,以绿肥、渣肥等有机迟效肥为主。柠檬喜肥,平时应多施薄肥。植株在萌芽前施一次腐熟液肥,以后每7到10天施一次以氮肥为主的液肥,促使多长枝叶、多发春梢。每次摘心后及时施肥,促使枝条提早老熟。柠檬生长期间可在盆面撒一些饼肥,使每次浇水都有肥料渗入土中,增强肥力。入秋后施肥减少,避免植株营养过剩、促发秋梢,与果实争夺养分而造成落果。