花椰菜病毒病的防治无特效药，只有在品种选择、育苗等关键环节上采取无公害综合防治技术，才能阻断病毒传播途径，减轻病害的发生。抗病品种是防病丰产的基础，花椰菜品种间对花叶病毒的抗性差异十分显著，应根据种植地的种植习惯或产品销往地的消费习惯选用不同类型的抗病品种。如天津市农业科学院蔬菜花卉研究所育成的夏雪40、夏雪50、丰花60、云山、津雪88和日本雪山、农友雪珍等秋植品种。
适期晚播，以使苗期避开高温期，浙江及长江中下游地区一般在8月下旬～9月上旬播种为宜，北京地区以立秋播种为宜。施足基肥，增施磷钾肥，控制少施氮肥。种子处理时，种子经78℃干热处理48小时可去除种子病毒。调整蔬菜布局，合理间套轮作，发现病株及时拔除。
适期早播，躲过高温及蚜虫猖獗季节，适时蹲苗应据天气、土壤及苗情掌握，一般轻蹲十几天即可。蹲苗时间过长，妨碍根系生长发育，容易染病。苗期遇高温干旱季节，必须勤浇水，降温保湿，促进植株根系生长，提高抗病能力。注意及时防治蚜虫，在苗期7叶前每隔7～10天防治蚜虫1次，也可用银灰色遮阳网或22目防虫网育苗避蚜防病。药剂防治时，在发病初期病毒抑制剂和生长促进剂配合施用。