甜瓜软腐病主要为害果实,有时也为害茎。病部初现水渍状深绿色班,扩大后稍凹陷,病部发软,逐渐转为褐色,病斑周围有水浸状晕环,从病部向内腐烂,散发出恶臭味。茎染病多始于伤口,病斑呈不规则形水渍状,向内软腐,病部出水,严重的烂断,致病部以上枯死。欧式杆菌软腐病亚种是甜瓜软腐病主要病菌,病菌会在病残体和土壤中越冬,随后通过昆虫、伤口、风雨等介质进行传播。整株或一支蔓的叶迅速枯萎死亡是其典型特征。受害株蔓出现暗绿色水浸状病斑,并形成软腐,同时与枯萎病相似,维管束变褐色。感病果实初为水渍状病斑,渐扩大,稍凹陷,病部发软,色泽变深,病斑周围有水渍状晕圈,从病部向内腐烂,有臭味。