对感染青霉菌的木耳应立即采收，并用1%的盐水进行清洗，晾晒、烘干。做好接种室、培养室、栽培场所周围的清洁卫生，并进行定期消毒灭菌，以减少初次污染，加强通风换气，防止青霉菌的发生和蔓延。
①把好拌料接种关。拌料的料水比一般以1∶1.2～1∶1.4（含水60%左右）较为适宜，不要用水浸泡原料，否则料因潮湿而透气性差，易霉烂。接种时加大播种量，这样黑木耳菌丝首先抢占料面而抑制杂菌生长。
②喷洒5%石灰水，调培养料pH为7.0，也可抑制其生长。
③对少数、局部表面污染的菌袋，用5%～10%石灰水洗刷，或用40%的甲醛溶液抹擦，然后撒石灰和多菌灵2∶1混合粉剂，便可控制其扩展。
严格管理，加强菌房的通风，降低培养温度和空气湿度，净化周围环境，可有利黑木耳菌丝生长，减少和防止其污染。
