蚜虫主要靠危害柑橘的嫩叶和嫩梢，吸食汁液，叶片被害后通常叶背会有许多灰褐色蜕皮壳，严重时叶片会卷曲、皱缩且不能正常伸展。后期还会造成新梢枯死，花蕾和幼果脱落等现象。蚜虫具有刺吸口器，常聚集在植物的嫩叶、果实等部位，吸取汁液为生。受害的嫩枝叶，严重者枝梢不能生发，果实受害后，由于缺乏营养物质的供应，常出现果实果品差，产量低。
蚂蚁分泌的蜜露会直接导致柑橘烟煤病的发生，由于蚜虫分泌的蜜露比较粘，粘在叶子部位，风吹不掉，最易遭致真菌的滋生，真菌发生过后，在叶片上留下一层煤灰一样的黑色物质，覆盖叶片上，严重影响叶片的光合作用。
一般危害柑橘树的蚜虫有柑橘二叉蚜、棉蚜、绣线菊蚜。棉蚜喜欢聚集在柑橘树的嫩芽、嫩叶和新梢部位进行危害，危害柑橘果树之后，叶片表现黄化，生长缓慢，受害的叶片基本不卷缩。受到绣线菊蚜危害的枝梢，大多会成为无用梢，表现簇生卷缩，叶片不能正常生长。
