辣椒病毒病的发生与环境条件关系密切，主要由黄瓜花叶病毒和烟草花叶病毒引起。黄瓜花叶病毒的寄主广泛，包括许多蔬菜作物，主要由蚜虫传播。烟草花叶病毒在干燥的病株残枝内长期生存，也可由种子带毒，经由汁液接触侵染。高温干旱天气不仅促进蚜虫传毒，还降低辣椒的抗病能力，黄瓜花叶病毒危害加重。多年连作、低洼地、缺肥或施用未腐熟的有机肥，均可加重烟草花叶病毒的危害。
辣椒病毒病的发生规律与气候条件和蚜虫发生密度相关。在高温、干旱、日照过强的气候条件下，蚜虫严重发生与繁殖，传播病毒，同时降低辣椒抗病能力，导致病毒病严重发生。与茄科或瓜类蔬菜连作、肥力差的地块发病重。尖椒发病率较低，甜椒发病率较高。
病毒可附着在蔬菜植株和田间杂草根部越冬，尤其在大白菜、萝卜种株或蔊菜、车前、龙葵等杂草上多被病毒附着。病毒有多种传毒方式，种子、土壤、烟草制品等都能带毒，通过接触或蚜虫等传播，经过微伤口侵入植株，导致发病。该病发生时间为5月中下旬，一般盛发期为6—7月，8月的高温干旱天气对病害发生有利，可进一步加重病情。
辣椒染病时间较长，苗期至成株期均可，但侵染率随生育期进程而呈降低趋势，对辣椒产量的影响程度也逐渐变小；辣椒2~4叶时的侵染率最高，要注意这一阶段的病虫防治工作。该病的发生与多种因素有关，如：重茬、蹲苗时间过长；移栽时天气不好；田间缺水缺肥，或单施氮磷化肥、缺少有机质；植株不健康；蚜虫发生量大且防治不力等。气候对该病的发生有较大影响，一般在温度超过33℃、相对湿度低于60%、光照较强的条件下病害呈重发趋势；在辣椒生长期间，雾的发生时间和强度对病害的影响也较大，发生时间长且强度大时可加重病毒病的发生。此外，不同品种其抗性存在较明显的差异，一般锥形椒抗病力较强，而灯笼椒抗病力相对较低。
辣椒病毒病于5月中旬至下旬开始发生，6-7月盛发，待8月高温干旱后，病情加重。辣椒从苗期至成株期均可被侵染为害。
