花生茎腐病可从出苗期至成熟期发生，主要危害子叶、根和茎，以根茎部和茎基部受害最重。重病地块在出苗前即可感病，导致烂种。苗期发病时，病菌从子叶或幼根侵入，导致子叶变黑褐色干腐，进而沿子叶柄侵入根颈部，形成黄褐色水浸状不规则病斑，扩展后绕茎或根颈一周形成黑褐色病斑，破坏输导组织，使维管束变黑褐色。发病初期叶色变浅，中期叶柄下垂、复叶闭合，严重时全株萎蔫。干燥时病部呈琥珀色下陷，髓部褐色干腐中空；湿度大时，病株变黑腐烂，产生黑色小粒点。
成株期发病，主茎和侧枝基部变黑褐色，蔓延至中部，使以上部分枯死。发病部位多在茎基部贴地面，有时主茎和侧枝分期枯死。该病造成大量或成片花生植株枯死、荚果霉烂或发芽，重病株荚果全部霉烂，轻病株部分果柄或荚果腐烂，不及时收获易提早发芽。
