花生茎腐病病菌主要在种子和土壤中的病残株上越冬。在田间传播，主要是靠田间雨水径流，其次是大风，不过农事操作过程中携带病菌也能传播。病菌主要随病残体遗落土中或混入土杂肥中越冬，也可粘附在种荚和种仁上越冬，借风雨或农事操作而传播，从寄主伤口或表皮直接侵入致病。该病的发生流行同天气、种子、栽培管理和品种抗性等因素有密切关系。温暖多雨，土壤湿度大，或大雨骤晴，土温变化剧烈，气候干燥，土表温度高，植株受灼伤，往往易诱发花生茎腐病。收获期雨水多，种荚未充分晒干就入库或入库后保管不善，造成种荚发霉，种子生活力降低，种子带菌率增加，播种后易暴发茎腐病。一般连作地、土壤结构和肥力差的地块，或者施用带病残体的土杂肥，发病严重；春花生比夏花生发病重，早播春花生较迟播的发病重。在大田，花生发病有两个高峰期：第1个高峰期是5月中下旬至6月下旬；第2个高峰期是7月中旬至8月上旬。第1个发病高峰常致大量幼苗死亡；第2个发病高峰期发生在高温的雨季，花生一旦感病，迅速扩展，造成大量或成片花生植株枯死，荚果霉烂和发芽等。在花生的整个生育期和发育期，若遇持续高温、多雨、高湿的天气，极易促发加重茎腐病的发生与危害，出现大面积的感病与发病。
花生茎腐病症状：茎腐病多在花生生长中后期发病，成株发病多在近地面茎基部第一对侧枝处。初为黄褐色水渍状病斑，后变为黑褐色，并向四周扩展包围茎基部，引起黑褐色腐烂，使地上部萎缩枯死，潮湿时病部密生黑色小粒（分生孢子器）。病株荚果腐烂，或种仁不饱满。花生茎腐病的流行与种子、土壤、气候以及栽培制度等因素有密切关系，种子带菌是发病主要因素。病菌借助农事操作、施肥及雨水传播，从根茎伤口或表皮直接侵入。通常连作、地势低洼、地力弱土层浅、持续低温阴雨或暴雨骤晴、或少雨干旱的不良天气易发病。花生茎腐病从苗期时即可染病，病菌通过花生的子叶和根系侵染整颗植株，刚开始染病后，在根茎部位会有病斑出现，颜色为黄褐色，随着病情的加重，颜色变成黑褐色，最后地上部分的植株开始失水，最终枯萎死株。
花生根腐病、茎腐病的流行与种子、土壤、气候以及栽培制度等因素有密切关系，种子带菌是发病主要因素。病菌借助农事操作、施肥及雨水传播，从根茎伤口或表皮直接侵入。通常连作、地势低洼、地力弱土层浅、持续低温阴雨或暴雨骤晴、或少雨干旱的不良天气易发病。根腐病苗期至开花前易受病菌侵染且发病较重，茎腐病苗期和结果期易发病。一般5月下旬至6月初出现病株，6月中下旬出现发病高峰。
