因地制宜地选用抗病良种。药剂处理种子是防治高粱黑穗病最重要、最简单、最有效的方法。①2%立克秀按种子重量的0.1-0.2%拌种(米汤拌种)或50%禾穗胺按种子重量的0.5%拌种。②用20%粉锈宁乳油100毫升,加少量水,拌种100公斤,力求拌均匀,摊开晾干后播种。③用20%萎锈灵乳油(或可湿性粉剂)0.5公斤,加水3公斤拌种40公斤,闷种4小时,晾干后播种。实行3年以上轮作,以减少土中菌量。提倡适期晚播,争取早出苗、出全苗。及时砍倒病株,在灰包破裂之前,将病株砍倒拉出地外集中销毁。做好田间观测,发现病株在孢子堆膜破裂散出黑粉前及时拔除带出田外深埋或烧毁。在发病期,应用针对性药剂加新高脂膜进行防治,防止病毒传播。用种子量0.5%的15%粉锈宁可湿性粉剂,0.8%的50%敌克松可湿性粉剂,0.2%的50%福美双可湿性粉剂,或用种子量0.3%的12.5%烯唑醇(速保利)可湿性粉剂进行药剂拌种。