根腐病是因半知菌亚门镰孢属、菜豆腐皮镰孢真菌侵染所致。病菌在病残体上或土壤中越冬，可存活10年左右。病菌主要借土壤传播，通过灌水、施肥及风雨进行侵染。病菌最适宜生育温度为29－30℃，最高35℃，最低13℃。土壤湿度大，灌水多，利于该病发展；连作、地势低洼、排水不良，发病较重。病菌主要以菌丝体和厚垣孢子在土壤病残体上越冬，其次在既肥中越冬，带菌土壤、田间的病残体或带菌的展肥是翌年的初侵染源，借雨水、灌溉水、农事作业传播，从寄主地下伤口侵入使皮层腐烂。发病后病部产生的分生孢子又借助雨水溅射或流水传播，进行重复侵染，致病害蔓延。病菌可在病残体或厩肥及土壤中存活多年，无寄主时可腐生10年以上；种子不带菌，初侵染源主要是带菌肥料和土壤，通过工具、雨水及灌溉水传播蔓延，先从伤口侵入致皮层腐烂。土壤含水量大，土质黏重易发病。