病菌在种子上或病残体内遗留在土壤中或在采种株上越冬。如播带病种子，幼苗出土时依附在子叶上的病菌从子叶边缘的水孔或伤口侵入，引起发病。成株叶片染病，病原细菌在薄壁细胞内繁殖，再迅速进入维管束，引起叶片发病，再从叶片维管束蔓延至茎部维管束，引致系统侵染。采种株染病，细菌由果柄处维管束侵入，进入种子皮层或经荚皮的维管束进入种脐，致种内带菌。此外也可随病残体碎片混入或附着在种子上，致种外带菌，病菌在种子上可存活28个月，进行远距离传播，在田间主要通过病株、肥料、风雨或农具传播。
一般与十字花科连作，或高温多雨天气及高湿条件，叶面结露、叶缘吐水，利于病菌侵入而发病。此外，肥水管理不当，植株徒长或早衰，寄主处于感病阶段，害虫猖獗或暴风雨频繁易发病。反季节栽培时遇上述条件发病重。
从幼苗期至成株期均可发病，幼苗发病是子叶呈水浸状，后迅速枯死或者蔓延至真叶；成株期发病主要危害叶片，先从叶缘处开始，后逐渐扩展成V字形枯斑，病斑呈黄褐色，边缘淡黄色。根部受害时，维管束会变黑，内部逐渐干腐，直至全株萎焉死亡，球茎发病时，从球面一点病斑逐渐扩散，在严重时会导致整个花球发黑、腐烂。
兰花黑腐病为害叶片和球茎，子叶染病呈水浸状后迅速枯死或蔓延到真叶上，真叶染病有两种类型，病菌由水孔侵入的，引致叶缘发病。
